В проливах, ведущих в море, по данным морских биологов, встречается 160 видов полихет, в Бельтах количество видов сокращается до 70, в северной части Балтики оно падает до 15, а в Ботническом и Финском заливах отмечено только четыре вида полпхет.

Анализ дойных осадков Балтийского моря показывает, что оно не всегда было рукавом Северного моря. На протяжении плейстоцена —ледниковой эпохи — Балтийское море неоднократно претерпевало изменения.

В какие-то периоды оно оказывалось покрытым мощным ледяным панцирем, достигавшим километровой толщины и более. Тогда море, вероятно, представляло собой лишь заполненный льдом бассейн, который в ходе медленных наступаний и отступаний ледника подвергался дальнейшему выпахиванию и шлифовке. В другие периоды, когда ледник отступал на север в более высокие арктические широты, Балтика становилась внутренним озером пли оказывалась связанной с древним Северным Ледовитым океаном.

В наши дни в отложениях древнего Балтийского бассейна найдены остатки вымершего арктического двустворчатого моллюска портландии  и гренландского тюленя. В солоноватых и почти пресных водах Балтики в Ботническом и Финском заливах еще и сегодня можно обнаружить несколько „живых ископаемых». Это четырехрогий керчак— мелкая пресноводная рыба, встречающаяся повсеместно в полярных водах, и два небольших беспозвоночных     мизида и бокоплав.